होली में रंग खेलने का वैज्ञानिक महत्‍व भी है। कहा जाता है कि, होलिका दहन के अगले दिन से चैत्र मास शुरू होता है और इसमें जीवाणुओं के सक्रिय होने का खतरा होता है। ऐसे में वायमुंडल में रंगों की मौजूदगी जीवाणुओं का नाश करती है। इतना ही नहीं रंग लगने के बाद उसे छुड़ाते समय शरीर की सफाई भी अच्‍छे से होती है।